法律分析：1、发放年终奖的当月工资高于5000元时，年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。2、当月工资低于5000元时，年终奖个人所得税年终奖-(5000-月工资))*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(5000-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》。第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税。（一）工资、薪金所得。（二）劳务报酬所得。（三）稿酬所得。（四）特许权使用费所得。（五）经营所得；（六）利息、股息、红利所得。（七）财产租赁所得。（八）财产转让所得。（九）偶然所得。