房产证遗失补证登记的程序如下：一、房产证遗失补证申请登记程序：档案馆查询、出具证明-遗失启示登报-配图—提交资料—交费领证。二、房产证遗失补证登记提交资料。1、房屋权属登记申请书(非转移类)。2、房屋分层分户平面图。3、申请补办报告。4、申请人身份证件复印件(查验原件)。5、遗失启示(整张报纸)。6、档案馆出具的挂失证明。7、委托书(申请人不能亲自办理时出具，须经过公证)。8、机关、事业单位、社会团体法人资格证书或企业法人营业执照副本复印件(查验原件)。9、法人授权委托书、代理人身份证件复印件(查验原件)。三、补办流程；1、房屋权利人应持身份证到市房管局，填写房产证遗失声明。2、到房产档案馆查档并出具房产权属证明（房产档案馆收取查档费用）。3、在所在地日报上刊登权属证书遗失声明。