农村耕地建房以拆除的方式来处理，因为国家对于农村耕地有着明文的规定，不允许村民私自将此地拿来建造房屋。若要在此用地上建房，则需按照相关程序进行申请，先土地性质转变成建设用地，经政府部门批准之后，方可在此用地上建房。如果未履行相关手续，在耕地上私自建房，由县级以上人民政府农业农村主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋；构成犯罪的，追究刑事责任。耕地上建违建房的后果如下：1、限期拆除。2、罚款（具体数额依据各地不同标准）。3、情节严重的将面临刑事拘留，根据我国《土地管理法》和《刑法》，占用耕地超过10亩，基本农田超过5亩的就属于犯罪了，要移送司法机构。【本文关联的相关法律依据】。《中华人民共和国土地管理法》。