RDA的每个环境因子的解释度

是的，准确点讲，不是相关性100%，是环境数据所能解释的物种数据变异，参考方差分解分析，通常这个解释率通常都很低，原因多多。包括未测定的指标，测量准确性低，空间自相关影响等等，根据我的经验你的已经算高了...

RDA是响应变量矩阵与解释变量之间多元多重线性回归的拟合值矩阵的PCA分析，展示方式一般有双序图和三序图。环境因子一般用箭头表示，箭头所处的象限表示环境因子与排序轴间的正负相关性，箭头与原点的连线长度代表着某个...

环境因子箭头的长度表示环境因子影响力大小。从样方点到数量型环境因子的箭头投影点，可以表示该环境因子的值在样方内的情况。如图中，尽管样方Sa4和Sa3的点到环境因子A的箭头距离不一样，但是A在这两个样方内的值应该上差...

RDA中通常使用标准化后的解释变量，因为在很多情况下解释变量具有不同的量纲，解释变量标准化的意义在于使典范系数的绝对值（即模型的回归系数）能够度量解释变量对约束轴的贡献，解释变量的标准化不会改变回归的拟合值和约束排...

RDA，即约束化主成分分析的进化版，它将环境因子纳入多元回归，为我们提供了一种名为多元直接梯度分析的强大工具(RDA=主成分分析+环境因子回归)。而CCA，堪称两组变量间关系的揭秘者，基于单峰模型，尽管存在“弓形...

每一个公因子对所有变量的解释程度百分之60到百分之80。因子数量，以及所提取的因子对变量的累积方差贡献值。累计方差贡献值达到60%及以上，因子对变量的解释能力可接受。达到80%及以上，说明因子对变量的解释能力极好。

其中R2为决定系数，代表变异被回归直线解释的比例。VPA（Variancepartitioninganalysis）方差分解分析，可用于定量评估两组或多组（2~4组）环境因子变量对响应变量（如微生物群落差异）的单独解释度和共同解释度，常配合RDA/...

3、如果表示环境因子的射线太短或太长，通过设置如下所示的参数进行等比例放大或缩小。输出：decorana.txt：判断用CCA分析还是RDA分析的文件；bioenv.txt：bioenv分析判断结果；rda.txt：记录环境因子(Constrained)与非环境因子(...

因子解释变量形心（Centroidsforfactorconstraints）：因子变量各个水平形心点的坐标，即每个水平所用标识为一的样方的形心。在rda()函数中大家感兴趣的典范特征系数（即每个解释变量与每个典范轴之间的回归系数），可用coef()...

那是总变异！前面1、2、3、4四个轴共解释了99.2%的变异